人类很多的疾病来自细胞、组织、器官坏死，从而导致功能丧失，引发人体残疾，甚至死亡，随着现代医学的发展，器官移植技术日趋成熟，单从手术角度来说：器官移植技术已很完美，换头手术都不是大问题。
而事实上，器官移植目前仍面临种种困难，除了肝、肾、骨髓、眼角膜等少数器官移植普遍临床应用外，其它器官移植手术进展非常缓慢，那么，制约器官移植发展的难题是什么呢？
临床器官移植比例也许有人说是器官来源，这算个难题，但绝对不是最大难题。告诉你：最大难题是术后问题，就是器官移植到病人身上后，器官能存活多长时间的问题。
上面说了，器官移植在手术室里面的神经、血管等各种对接手术已非常完善，那为什么器官移植后，在病人身上存活时间成为大问题呢？
原来，器官移植并不像机械换配件那样简单，器官移植到病人身上后，虽然安装、对接等手术没问题，但受体病人的身体里面存在免疫系统，免疫系统会识别到移植来的器官不是自己的，它们不认可这个外来的器官，从而对这个外来器官排斥、断其营养、围攻阻杀、最后导致移植器官死亡，这才是困扰器官移植的最大难题。
免疫排斥人体的免疫系统具有排它性，即人体内部不接受外来的“异物、异己”成分，对“异己”的成分会本领的排斥、清理和攻击，免疫系统如同人体*队，这种“排异”的本领，能有效的清理和攻杀外界的病*和病菌，从而保护人体的健康，这是非常重要的系统功能，但是，在器官移植问题上却成了最大障碍，看来，什么事物都有利就有弊。
为了解决人体的“排异”难题，在器官移植手术时，医生们想尽了各种办法：
第一种办法：拆东墙补西墙。例1：大面积烧伤病人，需要移植皮肤，医生采用从病人其它未烧伤的地方切割皮肤，移植到烧伤部位；例2：病人手指断了，切断病人的脚趾移接到手指；例3：先天性的兔唇患者，从患者的臀部割肉补缺。这些手术实例，是医生普遍采用的方法，为什么？就是为了避开人体免疫，免疫系统对于自己的组织、器官成分，不仅不会排斥，还会细心呵护，所以，移植自身的组织、器官非常容易成活，而且是永久性的。
器官移植手术第二种办法：亲近血缘配对。血缘关系越近，基因的相似度就越高，免疫的排斥性就越小，器官移植的成活率就越高，成活的时间就越长。例如，白血病的骨髓移植一般都采用血缘亲近人的骨髓，其它器官移植，一般来说也是血缘关系越近越好。
第三种办法：严格配型。就是把器官供体作为抗原，把受体作为抗体，进行实验配对，两者排斥较低的作为可供配对，这样能有效减低器官移植后的免疫排斥反应，从而提高受体器官移植的成活率和移植器官寿命。
器官捐献第四种办法：服用抑制免疫排斥的药物。器官移植手术中，只要是外来器官移植，手术后，病人体内或多或少的都会发生免疫排斥反应，有的是急性的，有的是慢性的，大部分是长期的。所以，医生强调术后病人一定要服用抑制免疫排斥的药物，从而减低免疫对移植器官的排斥和攻击，保护其成活和长久，随着抑制药物的发展，移植器官的寿命越来越长，达到30至40年的，都有大量案例。
但是，病人长期服用抑制免疫排斥类药物，不仅是经济上的大负担，而且在抑制移植器官排斥作用的同时，也大大的降低了病人的免疫抵抗力，导致病人易患各种感染性疾病，有时候，因病人易患感冒就前功尽弃。
克隆技术第五种办法：器官克隆培养。这是前沿科学，处在研究和实验阶段，就是事先将受体人的器官进行技术克隆，然后有效培养，需要时做当事人的供体，从而避免了排斥反应。
总之，攻克免疫排斥难题是器官移植的首要问题，目前，为什么只有肾、肝等少数器官移植被广泛临床应用，就是因为这几类器官移植过程中，免疫排斥程度最小，最易被控制，移植的器官成活时间最长，因而具有临床应用的意义，而更多的器官移植，由于人体免疫排斥严重，导致移植器官存活时间太短，临床应用价值不高。